深圳前海湾保税港区成立于2008年，此后，深圳检验检疫局始终关注着深圳前海湾保税港区的建设、运作以及发展。在经过多年见证前海湾的稳定快速发展，深圳检验检疫局决定在2012年4月13号这天在前海湾保税港区正式挂牌成立办事处,深圳市委常委、深圳检验检疫局以及市政府等有关领导出席了揭牌仪式。在这同一天，深圳市前海湾保税港区管理局与深圳检验检疫局签署了《关于促进前海湾保税港区改革与发展的合作备忘录》，同时再采取23条详细的措施，两个部门决定从5个方面入手，来提供保税港区的简便快速通关，促进港区的经济发展。
5个方面的具体内容是：
1、双方通力合作，采用合作执法机制。同保税港区管理局加强合作，做好对重点企业和引进目标企业的服务，同时出台有关措施与扶持制度想兼顾，以达到保税港区的稳定发展；
2、打造良好的口岸环境，建设通关智能信息化的模式。积极配合保税区管理局建设物流与仓库等工作平台，建立两局的通关智能化系统，例如“海港全申报系统”、“口岸自助换证系统”等。试行“无纸化通关、事后递单”的方式，提供通关效率；
3、加强质量体系建设，提高通关效率；
4、出台政策引导企业，促进外贸的增长。两局根据情况，出台相关政策法规及措施，引导扶持企业，让企业的产品走出去；也应大力培养一批著名品牌和进出口龙头企业；以这样的多重灵活的方式来促进港口出口方面的增长；
5、强化监管体系的创新，业务流程的重造。